《苏铁基因组和种子植物早期演化》成果于4月18日晚上11点在国际植物学顶刊《Nature Plants》荣登封面文章,这在深圳市城市管理和综合执法局支持的科研项目中属首次。文章的发表代表着种子植物基因组演化研究中的最后一块拼图完成,种子植物各大分支的基因组到现在均已覆盖。
深圳市城管和综合执法局4月19日公布,项目由深圳市仙湖植物园联合深圳华大生命科学研究院、中国科学院昆明植物所、兰州大学、中国环境科学研究院、河南大学以及南京林业大学等22家单位65位科学家共同完成;该文章的发表,代表着种子植物基因组演化研究中的最后一块拼图完成,种子植物各大分支的基因组到现在均已覆盖。
该成果是仙湖植物园2022年第二篇发表在国际著名学术期刊的文章。2022年1月, 植物园李凌飞博士等人在《新植物学家》发表了《秋海棠基因组揭示其多样性形成及适应性进化机制》,两篇文章加上2021年3月份发表的《望春玉兰基因组揭示了其高挥发油含量的遗传基础》是仙湖植物园与深圳华大生命科学研究院等共同主持并完成的第三个成果。
攀枝花苏铁是我国特有物种,也是全球苏铁类分布纬度最北类群,其基因组较大,结构复杂。给科研工作增添了不少难度。该成果以攀枝花苏铁为研究对象,通过不同的测序技术,确定苏铁基因组大小为10.5 Gb,共注释了32,353个蛋白编码基因,这是目前裸子植物中最高质量的大基因组图谱,研究成果数据公开分享,全球的科学家均可免费下载。
苏铁起源于2亿7千万年前,一直以来被认为是活化石,其在种子植物“生命之树”位置也一直有争议,项目团队明确了苏铁的系统位置,证实了现在的苏铁类群是在中新世以来气候剧烈变化引起的辐射演化,也就是说现在的苏铁并不古老,其分化多在1100-2000万年之间。
研究者首次发现: 现存裸子植物的最近共同祖先可能经历了一次古老的全基因组复制事件并命名。这个加倍与种子起源相关, 许多关键创新性状如种子发育、花粉、次生生长相关的基因家族均发生了创新或扩张。
对苏铁不开花时雌雄难辨这一情况,项目团队通过62株雌雄苏铁群体测序,确定了苏铁的性别决定系统为XY系统,与人类一致。发现了性别决定的关键基因MADS-Y基因,推测其调控雌雄的性器官发育。苏铁和银杏保留精子,肉眼可见,是整个生物界最大的,具鞭毛能运动,通过与鞭毛结构相关的基因组数据挖掘,进一步证实了苏铁在种子植物演化中古老的地位。
项目组基于基因重组技术,发现在苏铁中的细胞毒素蛋白对小菜蛾和棉铃虫有显著致死性,目前该发现已经应用在抗虫棉的创制,事实证明比现有的抗虫棉效果更高,可在棉花种植中进行推广,因其毒性蛋白属植物来源, 也使其对玉米等农作物具有更安全更高的保护性。